学院现有在校学生1300余人，近60％的学生获得校内、外各类奖励和表彰。历届毕业生以其经营、科技、管理复合型的知识、能力结构以及“上手快、后劲足、适应性强”受到用人单位好评。毕业生就业率100。
医学院
医学院是南通大学规模最大的二级学院，渊源于1912年民族实业家、教育家张謇先生创立的医学专门学校，至今已有98年的办学历史。回顾近百年的办学历史，医学院续衍着悠久而厚重的文化底蕴，秉承着“祈通中西，力求精进”的人文精神，谱写着光辉而艳丽的育人篇章。
学院设有人体解剖、组织学与胚胎学、生理学、病理学等11个基础医学教研室，设有诊断学、外科学总论、内科学、外科学、妇产科学、儿科学等20个临床医学教研室及医学信息学、医学人文学教研室，设有5个基础医学教学实验中心及4个临床医学教学实验中心，12个研究所和研究室。
学院现有江苏省高校国家重点学科培育点1个、省级重点学科4个、江苏省高校重点建设学科1个、省级“十大临床医学中心”1个、省级“135”医学重点学科2个、省级“135”医学重点建设学科2个、江苏省临床医学重点专科12个、江苏省优秀学科梯队2个、江苏省优秀科技创新团队1个。省一级学科博士学位授权建设点1个，二级学科博士学位授权建设点8个，人体解剖学与组织胚胎学已依托苏州大学联合培养博士，有2个一级学科硕士学位授权点、27个二级学科硕士学位授权点。
近五年来，我院承担市级以上科研课题265项，其中承担国家级科研项目31项，部省级科研项目85项，市级课题173项；获市级以上科研成果奖206项，其中，国家科技进步三等奖1项，省科技进步奖8项，省厅级科研成果奖57项，市科技进步奖143项。学院以第一作者单位发表SCI论文210余篇。学院协办《中华医学教育杂志》，是《中国高等医学教育》的会员单位。
学院重视对外交流与合作，已与美国、日本、德国、澳大利亚、印度、巴基斯坦等国家的医学教育、医疗卫生和科研机构建立了双边合作、学术交流关系，聘请了一批知名专家、学者担任学院名誉教授、客座教授。同时，学院也先后派出了百余名教师出国交流访问、留学进修。
学院有一支教学经验丰富、医疗技术精湛、学术水平较高的师资队伍，现有正高职156人，副高职221人，另外还有一大批兼职教师；博士生导师10人，硕士生导师198人。学院教学条件优越，教学科研仪器设备精良，能满足基础医学与临床医学各专业的教学科研工作需要。现有供各专业临床教学和毕业实习的附属医院16所，教学实习医院53所。
学院现有临床医学、口腔医学、医学影像学、医学信息学、康复治疗学、药学等6个本科专业。临床医学专业为国家级特色专业建设点、江苏省品牌专业建设点，医学影像学专业为江苏省特色专业建设点。
目前学院全日制在校生4024人，其中博士生21人，硕士研究生619人，留学生271人，全日制本专科生3113人。在长期的办学实践中，强调对学生的基础理论和创新能力的培养教育，注重人文知识教育，拓宽学生的知识面，大力加强学生的实践教育，培养学生的动手能力。
学院的毕业生素以基础扎实、实践能力强、勤奋实干而著称。毕业生遍及全国各省市，为我国的医疗卫生事业作出了贡献，受到社会的充分肯定和广泛赞誉，他们中的一大批人已成为医疗、科研、教学和管理的中坚。
公共卫生学院
公共卫生学院设有6个教研室、1个省部共建实验中心、1个生命分析化学研究所、1个公共卫生技术服务与创新平台及1个省级农作物安全性毒理学评价公共服务平台。现有教职工58人，其中博士生导师1人，硕士生导师13人，有博士、硕士学位的教师占85以上。卫生统计学与流行病学、医学检验具有硕士学位授予权。预防医学专业为江苏省特色专业、国家品牌专业建设点，医学检验为江苏省重点医学学科。卫生统计学、医学统计学被江苏省教育厅评为一类优秀课程和省优秀研究生课程。目前有预防医学、公共事业管理(卫生经济与管理)、医学检验3个本科专业，在校本科生、研究生近800人。
学院拥有万元以上大型仪器设备50多台(件)，仪器设备总固定资产约3800万元，实验室通过了省教育厅的合格评估验收。目前学院已在江苏省疾病预防控制中心及省辖市疾病预防控制中心及卫生监督所和上海市华东、长海等医院建立了41家教学实习基地。
近年来，学院主持和参与国家、省部级等科研课题22项，其中国家“863”项目3项，国家自然科学基金4项。发表学术论文100余篇，其中SCI收录21篇。学院已在流行病学与卫生统计学、预防医学、医学检验等方面形成了特色。
护理学院
南通大学护理学院坐落于风景优美的启秀校区,学院具有护理学硕士学位授予点。设有基础护理学、临床护理学、人文护理学教研室和护理学院实验中心，拥有一支敬业且充满活力的师资队伍，其中副高职称以上教师占45.5，中级职称教师40.3。面对护理人才的国际化，学院积极实践双语教学和合作办学，以适应护士人才国际交流的趋势。学院面向全国招收护理学专业学生,目前全日制在校本科学生400余人。
护理学院实验中心设有基础护理实训室、监护模拟病房、手术室、治疗室、监控室、示教室等，设有与医院病房功能相当的各种医护设备和教学设备，现有模拟病床40余张，并规划在原有实训中心的基础上建设护理综合技能实训室、母婴护理实训室、重症监护ICU等，引进美国纳斯等最新模拟训练设备，将先进的实验模拟设备与临床资源综合利用，保证护理教育培训项目的全面开展。
护理学院以“博爱、笃学、进取”为院训，重视学生综合素质培养，定期开展职业辅导，举办护理学基础技能比赛、英语竞赛、社区服务和社会实践活动，连续多年获得省、市级相关荣誉称号。学院注重实践教学，实习基地均为三级甲等综合医院，目前建有南通大学附属医院及上海、南京、苏州、无锡、常州等地临床实习基地14个。护理学院学生在道德风尚、学习风气、专业成绩、英语计算机能力、毕业生就业率等各方面表现突出，毕业生较高的综合素质为学院赢得了良好的社会声誉。
体育科学学院
体育科学学院现有体育教育、社会体育两个本科专业和一个体育教育训练学硕士学位授予点。体育教育专业先后被评选为江苏省教育教改试点专业、江苏省特色专业和南通大学品牌专业建设点，是江苏省培训体育师资的主要基地之一。学院先后三次被江苏省教育厅授予体育工作先进单位等荣誉称号。
体育科学学院现任教师中教授、副教授42人，博士、硕士41人。国家级、一级裁判员30人，曾担任过亚洲运动会、世界大学生运动会、2008北京奥运会等大型国际比赛的裁判工作。近年来，有多名教师受到教育部、江苏省人民政府、江苏省教育厅和南通市人民政府表彰和奖励。共主持研究国家级课题2项，教育部、江苏省教育规划等市厅级以上课题30项；发表论文680余篇，其中核心期刊90余篇；出版专著、编著和主编教材34部，28项成果获市厅级以上科研奖励和江苏省高等教育教学成果一、二等奖等。
2009年5月，学院代表江苏省参加“第五届全国体育教育专业学生基本功大赛”获得全体总分一等奖、理论知识类团体总分一等奖、技术技能类团体总分一等奖。校龙狮代表队多次在国际国内大赛中获银奖、铜奖。武术队获得“新世纪杯”中国邯郸第十一届国际太极拳运动大会金、银、铜奖；第五届中国焦作国际太极拳交流大赛冠军。田径队队员获得中华人民共和国第八届大学生运动会女子标枪冠军。
学校拥有比较完善的体育设施。现有体育馆、游泳池、体操馆、乒乓房、健身房、健美操房等室内场馆；有包括中国田径协会检验合格的标准400米塑胶田径场5片和300米塑胶田径场1片；有网球场、篮球场和排球场等室外运动场地近百片。
艺术学院
艺术学院现有教职工100人，其中专任教师88人，有教授9人，副教授20人，博士2人，硕士43人、硕士生导师10人。学院拥有4幢艺术楼和相配套的教学楼，其中有多媒体教室、电脑机房、学生画室、雕塑工作室、工业设计室、染织工作室、展厅、琴房、演出厅等较为完善的教学设施。
学院现设有美术学硕士点，有美术学、艺术设计、工业设计、音乐学、音乐表演等5个本科专业，培养德才兼备、品学兼优的高层次专业人才。毕业生受到各用人单位的欢迎，就业率一直保持在97以上。
近几年来，学院承担省厅级科研课题25项、校级课题23项，其中五项获得省级三等奖。教师撰写出版专著20部，参编国家级教材8部，出版画册9部，发表学术论文300篇，参展发表美术作品282件，获省厅级各等级奖55项，在国内外举办个展、个人音乐会28人次，部分作品被选送参与国际交流，并被国家博物馆、艺术画廊等收藏，学院组织参与的环境艺术设计工程受到省内外专家好评。
地理科学学院
地理科学学院设有地理科学(师范)、地理信息系统、资源环境与城乡规划管理、旅游管理、环境科学5个本科专业，现有教职工49名，专任教师中有正副教授8人、博士(含在读)14人，硕士以上学历人员占专任教师总数的93。教师承担国家自然科学基金项目2项，省(部)、市(厅)级科研项目多项。在籍全日制本科学生786名。多年来的建设和发展，学院形成了团结、严谨、务实的办学风格。
为适应社会的需要，学院重视学用结合，强化实验和实习环节，提高学生的实践能力。设有财政部、江苏省共建地表过程实验室；建立了自然地理学、地理信息系统、城市规划、制图与遥感、环境学5个专业教学实验室；还设立了江西庐山、南京汤山等数十个校外教学实践基地。
学院加强常规管理，开展多种活动，丰富学生的课余生活。通过与校外企事业单位共建就业基地等形式，为学院毕业生就业构建平台。历年毕业生就业率100，被评为南通大学就业工作先进集体。
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麻省理工院系设置、武汉大学计算机学院、武汉大学城市设计学院、中央财经大学院系设置、华南师范院系设置、系部专业设置、人大院系设置、海南师范院系设置、香港大学专业设置
