中国海洋大学：155项
中国海洋大学共获批各类项目155项，获批直接经费10617万元，较去年同期分别增长13.14和39.22，项目数和经费数均创历史同期最好成绩。获批项目类型包括创新研究群体项目1项，国家杰出青年基金项目3项，优秀青年基金项目3项，重点项目5项，重点国际（地区）合作项目1项，面上项目81项，青年基金项目57项，国际（地区）合作交流项目3项，专项项目1项。
海南大学：150项
海南大学获批项目150项，其中面上项目13项，青年项目39项，地区项目97项，联合基金重点项目1项，实现了新的突破。获资助数量较去年同期的102项增加了48项，增幅为47.06；获批直接经费5295万元，较去年的3527万元增加了1768万元，增幅为50.13；平均资助率为19.43，较去年的15.18增加了4.25。
北京工业大学：149项
北京工业大学共有149个项目获资助，其中重点项目4项、面上项目80项、青年项目60项，杰出青年科学基金项目2项、优秀青年科学基金项目3项，直接经费合计8608.7万元，“十四五”开局之年获资助项目数再创新高。
西南大学：148项
2021年，西南大学的国家自然科学基金项目申报创历史新高，集中申报接收期间共申请国家自然科学基金项目857项，除部分正在评审的项目还未公布结果外，暂时获准立项148项，批准直接经费暂为6773万元，项目资助数在重庆市相关依托单位中暂列第三位。从项目类别来看，西南大学今年斩获了优秀青年科学基金项目2项，重点项目1项。同时，还获批面上项目79项、青年科学基金项目66项。
上海中医药大学：147项
上海中医药大学共获资助项目147项，其中重点项目2项、优青项目2项、面上项目76项、青年项目67项，总直接经费6773.7万元，立项数和经费数均刷新以往成绩，立项数和经费数较去年分别增加17.6和18.7。
西北大学：144项
西北大学共有144项项目获得资助，其中重点项目4项，优青项目1项，面上项目67项，青年基金71项，国际合作项目1项。
昆明理工大学：143项
昆明理工大学2021年集中受理期共申请项目877项，首批获资助143项，比去年同期增加10项，资助直接经费5919.6万元，获资助项目数和资助经费稳中有涨，再次位居云南省第一位。其中，灵长类转化医学研究院陈永昌教授获国家杰出青年科学基金项目立项资助，是昆明理工大学培养的第二位国家“杰青”；环境科学与工程学院潘波教授、灵长类转化医学研究院李天晴教授获重点项目立项资助，保持了近几年重点项目立项不断线的良好势头。
广东工业大学：141项
广东工业大学共有141项（不含重大仪器、科学中心、重大研究计划、部分联合基金等）项目获得资助，资助金额为7318万元，其中包括创新研究群体项目1项，实现零的突破；获得国家杰出青年项目1项，是广工连续三年获得此类型项目；获得优秀青年基金项目3项，创广工该类型项目历年立项数历史新高。
青岛大学：139项
青岛大学首批获资助项目139项，其中杰出青年基金1项，国际（地区）合作交流项目1项，面上项目46项，青年基金91项，获批直接经费5233万元。
中国石油大学（华东）：131项
中国石油大学（华东）共获各类型资助项目131项，直接经费7165万元，获资助项目包括重点项目3项、重点国际(地区)合作研究项目1项、优秀青年科学基金项目2项、面上项目75项、青年科学基金项目50项。
太原理工大学：127项
以太原理工大学为依托单位，共有127个项目获得资助，获批直接经费4789万元。其中，优秀青年科学基金项目1项、面上项目46项、青年科学基金项目79项、国际（地区）合作交流项目1项，立项总数和青年科学基金立项数达到历史最好水平。
宁波大学：122项
宁波大学获122项国家自然科学基金项目，立项项目数再创历史新高，平均项目资助率达20.54。获批项目为：国家优秀青年科学基金项目2项，重点项目1项，面上项目46项，青年项目72项，国际合作项目1项。青年项目资助数首次超过70项。
北京交通大学：120项
北京交通大学共获批120项，较上年增长17.65，获批直接经费共计6527万元，较上年增长29.68，获批资助率为23.58。本次获批的120个项目包括，国家杰出青年基金项目1项；重点项目1项；重点国际（地区）合作项目2项，优秀青年基金项目2项；面上项目64项；青年基金项目50项。
华南农业大学：116项
华南农业大学共有116个项目获得立项资助，其中，兽医学院刘雅红教授团队获创新研究群体项目，获直接经费1000万元；生命科学学院王海洋教授获重点项目资助，材料与能源学院潘振晓教授和植物保护学院程代凤副教授分别获化学科学部和生命科学部优秀青年科学基金资助。
哈尔滨医科大学：112项
哈尔滨医科大学本年度集中受理期申报项目842项，共获资助112项，其中重点项目1项，面上项目70项，青年科学基金项目41项，总直接经费5275.50万元。
安徽医科大学：107项
安徽医科大学共107个项目获得资助，资助直接费用3751万元，其中，面上项目39项、青年科学基金项目67项、国际合作交流项目1项，连续第二年立项数突破百项大关。
中国地质大学（北京）：106项
中国地质大学（北京）本次共有106个项目获得资助，包括创新研究群体项目1项、重点项目4项、杰出青年科学基金项目2项，优秀青年科学基金项目2项、面上项目42项、青年科学基金项目55项。直接经费资助7130万元，获批资助率为29.94。
安徽大学：106项
安徽大学共有106个项目获国家自然科学基金立项资助，直接经费达4047万元。
广州大学：106项
广州大学本年度共申报国家自然科学基金项目585项，立项106项，直接费用合计为4890万元。其中，优秀青年基金2项，面上项目52项，青年科学基金51项，重点项目1项，立项率18.12。
广州中医药大学：103项
广州中医药大学共获各项资助103项，其中面上项目49项，青年科学基金项目54项，总直接经费4039万元，总立项数、总直接经费数和资助率均处于全国中医药高校前列。
南通大学：100项
南通大学共获资助项目100项，资助直接费用3907.4万元，其中重点项目1项、面上项目38项、青年科学基金项目59项、其它专项基金项目2项。
中国人民大学：99项
中国人民大学获得资助99项，获资助直接经费5229万元。在2020年获得78项，取得历史上集中受理期项目最好成绩后，又取得了新的突破。立项数较2020年增长27，较2019年翻了一番。常规项目的立项直接经费首次突破5000万元。其中，重点项目3项，优秀青年科学基金4项，面上项目53项，青年科学基金项目39项。
贵州医科大学：97项
贵州医科大学获批国家自然科学基金项目97项，其中重点项目1项，面上项目10项，青年基金12项，地区基金74项，直接资助经费3678.2万元，项目经费较去年增长16.95，获批项目数量再次刷新历史最好成绩。
广西医科大学：97项
广西医科大学共获得立项资助97项，其中面上项目7项，青年科学基金项目15项，地区基金项目75项，获直接经费3307.30万元，项目立项数和资助经费较去年同期均呈稳步增长趋势。
昆明医科大学：97项
昆明医科大学共计97项获准立项，同比去年增加了14项，增幅为16.9，立项数位居云南省第三位。其中，地区科学基金项目88项，面上项目5项，青年科学基金项目4项，获资助直接经费3362万元，比去年增加了554万元，增幅达20。
长安大学：92项
长安大学共有92项项目获得资助，同比增长3.4，其中重点项目1项、优秀青年科学基金项目1项、面上项目41项、青年科学基金48项、专项项目1项。资助项目直接费4050万元，同比增长2.3。
西安理工大学：92项
西安理工大学获资助92项，创集中申报阶段历史新高，其中国家杰出青年科学基金项目获资助1项，重点项目1项，面上项目39项，青年科学基金项目51项，直接经费共计4186万元。
中国石油大学（北京）：89项
中国石油大学（北京）89个项目获2021年国家自然科学基金资助，其中包括国家杰出青年科学基金项目1项、优秀青年科学基金项目4项。
华中师范大学：88项
华中师范大学共获批各类项目88项，资助率达到34.5，获批项目数和资助率均创华中师范大学最好成绩。据统计，华中师范大学今年共获批面上项目59项，青年科学基金项目27项，物理学院杨亚东教授获批重点项目1项，物理学院罗晓峰教授获批优秀青年科学基金项目1项。
遵义医科大学：86项
遵义医科大学获批各类项目资助86项，获资助直接经费2987.60万元。其中，面上项目5项，青年科学基金项目7项，地区科学基金项目74项。
山东第一医科大学：85项
山东第一医科大学（山东省医学科学院）共有85项申请获得资助，其中，重点项目1项，面上项目22项，青年基金62项，获直接经费资助近3000万元，立项数量和经费数较去年均有稳步提升。
长沙理工大学：83项
长沙理工大学共有83项课题获立项资助，其中面上项目44项、青年科学基金38项、国际合作交流项目1项。立项总数再创历史新高，位列湖南省属高校第一。
陕西师范大学：80项
陕西师范大学共获准立项80项，资助直接费用3490万元，资助率为20.73。获得立项的项目包括青年科学基金项目40项，面上项目39项，重点项目1项。
福建师范大学：80项
福建师范大学集中申请的项目共获批79项（资助经费3595万元），按类别分布：重点项目1项、重点国际（地区）合作研究项目1项、面上项目36项、青年项目41项。此外，福师大还获非集中申请的国际(地区)合作与交流项目1项，截至目前，累计获批80项。
石河子大学：79项
石河子大学2021年度获批国家自然科学基金项目79项，资助直接经费2727.40万元，立项数和立项经费位列疆内高校首位。
江西农业大学：79项
江西农业大学立项项目再创历史新高，共计79项，立项数位居省内高校第二，获资助直接经费2691万元，平均立项率为22.1。
东华理工大学：76项
东华理工大学获批国家自然科学基金项目数再创历史新高，立项总数达76项，资助经费达2761万元，资助经费位列江西省高校第二。
上海理工大学：75项
上海理工大学获批资助75项，项目立项数创历史新高，同比增长23，其中面上项目31项，青年项目42项，并斩获两项国家优秀青年基金项目
