吉林工业大学（入吉林大学）
武汉汽车工业大学（入武汉理工大学）。
归省市直属16所：
1、江苏理工大学（原镇江农机学院，现并入江苏大学）
2、东北重型机械学院（燕山大学）
3、陕西机械学院（西安理工大学）
4、上海机械学院（上海理工大学）
5、沈阳工业大学
6、哈尔滨理工大学（原哈尔滨电工学院与哈尔滨科技大学合并）
7、甘肃工业大学（兰州理工大学）
8、洛阳工学院（原洛阳农机学院，现合并入河南科技大学）
9、太原重型机械学院（太原科技大学）
10、北京机械学院（现合并入北京信息科技大学）
11、湖北汽车工业学院
12、沈阳理工大学
13、湘潭机电高等专科学校（合并组建湖南工程学院）
14、郑州工业高等专科学校（合并组建河南工业大学）
15、南京机械高等专科学校（合并组建南京工程学院）
16长春汽车工业高等专科学校
交通部（现交通运输部）共10所：
部委直属1所：
大连海事大学（“世界一流学科建设高校”“211工程”）
并入教育部直属高校3所：
1、西安公路交通大学（入长安大学）
2、武汉交通科技大学（入武汉理工大学）
3、南京交通高等专科学校（入东南大学）。
归省市直属6所：
1、上海海运学院（上海海事大学）
2、长沙交通学院（现合并于长沙理工大学）
3、南通医学院（现合并于南通大学）
4、重庆交通学院(重庆交通大学)
5、济南交通高等专科学校（山东交通学院）
6、广州航海高等专科学校（广州航海学院）
轻工业部（1993年撤销改组为轻工总会-轻工业局，由经济贸易委员会管理。2001年轻工业局撤销，中国轻工业联合会成立）共8所：
归教育部直属1所：
江南大学（“世界一流学科建设高校”“211工程”）。
并入教育部直属高校1所：
中央工艺美术学院（入清华大学）。
归省市直属6所：
1、天津轻工业学院（天津科技大学）
2、西北轻工业学院（陕西科技大学）
3、北京轻工业学院（合并于北京工商大学）
4、景德镇陶瓷学院
5、郑州轻工业学院
6、大连轻工业学院(大连工业大学)
铁道部（2013年撤销，企事业单位归入铁路总公司，行政管理职能归入交通运输部）共10所
归教育部直属2所：
1、西南交通大学（“世界一流学科建设高校”“211工程”）
2、北京交通大学（“世界一流学科建设高校”“211工程”）。
并入教育部直属高校3所：
1、长沙铁道学院（入中南大学）
2、上海铁道大学（入同济大学）
3、南京铁道医学院（入东南大学）。
归省市直属5所：
1、大连铁道学院（大连交通大学）
2、兰州铁道学院（兰州交通大学）
3、华东交通大学
4、石家庄铁道学院（石家庄铁道大学）
5、苏州铁道师范学院（合并于苏州科技学院）
建设部（改组为住房与城乡建设部）共8所
并入教育部直属高校4所：
1、重庆建筑大学（入重庆大学）
2、西北建筑工程学院（入长安大学）
3、武汉城市建设学院（入华中科技大学）
并入工业与信息化部直属高校1所：
哈尔滨建筑大学（并入哈尔滨工业大学）。
归省市直属3所：
1、沈阳建筑工程学院（沈阳建筑大学）
2、南京建筑工程学院（合并于南京工业大学）
3、苏州城市建设环境保护学院（合并于苏州科技学院）
中国建筑工程总公司（原国家建工总局，现中国建筑集团有限公司）共1所：
并入教育部直属高校1所：
重庆建筑高等专科学校(并入重庆大学)
建材工业局（2001年撤销，改组国家建筑材料工业协会-中国建筑材料联合会），共5所
归教育部直属1所：
武汉理工大学（“世界一流学科建设高校”“211工程”）
并入教育部直属高校1所：
上海建材学院(入同济大学）
归省市直属3所：
1、西南工学院（现合并于西南科技大学）
2、山东建材工业学院（合并济南大学）
3、洛阳工业高等专科学校（洛阳理工学院）
农业部（现农业农村部）共13所
归教育部直属5所：
1、中国农业大学（“世界一流学科建设高校”“211工程”）
2、南京农业大学（“世界一流学科建设高校”“211工程”）
3、西北农林科技大学（世界一流大学建设高校B类”“985工程”，“211工程”）
4、华中农业大学（“世界一流学科建设高校”“211工程”）
5、西南农业大学（并入西南大学）
归省市直属9所：
1、沈阳农业大学
2、华南农业大学
3、东北农业大学
4、华南热带作物农业大学（合并于海南大学）
5、上海水产大学（上海海洋大学）
6、石河子大学（“世界一流学科建设高校”“211工程”，新疆建设兵团直属）
7、大连水产学院（大连海洋大学）
8、塔里木农垦大学（塔里木大学）
林业部（1998年改组为林业局，2018年改组为林业与草原局）共7所
归教育部直属2所：
1、北京林业大学（“世界一流学科建设高校”“211工程”）
2、东北林业大学（“世界一流学科建设高校”“211工程”）。
并入教育部直属高校1所：
西北林学院（入西北农林科技大学）。
归公安部直属1所：
南京森林公安高等专科学校（南京森林警察学院）。
归省市直属3所：
1、南京林业大学
2、中南林学院（中南林业科技大学）
3、西南林学院（西南林业大学）
卫生部（现卫生健康委员会），共11所
并入教育部直属高校9所：
1、北京医科大学（入北京大学）
2、上海医科大学（入于复旦大学）
3、中山医科大学（入中山大学）
4、华西医科大学（入四川大学）
5、同济医科大学（入华中科技大学）
6、湖南医科大学（入中南大学）
7、白求恩医科大学（入吉林大学）
8、山东医科大学（入山东大学）
9、西安医科大学（入西安交通大学）。
部委直属1所：
中国协和医科大学（现北京协和医学院，“世界一流学科建设高校”）
归省市直属1所：
中国医科大学
药品监督管理局，共2所
归教育部直属1所：中国药科大学（“世界一流学科建设高校”，“211工程”）。
归省市直属1所：沈阳药科大学
中医药管理局，共3所
归教育部直属1所：北京中医药大学（“世界一流学科建设高校”，“211工程”）。
并入教育部直属高校1所：北京针灸骨伤学院（入北京中医药大学）。
归省市直属1所：广州中医药大学
外经贸部（2003年商务部组建，对外贸易经济合作部撤销）共4所
归教育部直属1所：
对外经济贸易大学（“世界一流学科建设高校”，“211工程”）。
并入教育部直属高校1所：
天津外贸学院（入南开大学）。
归省市直属2所：
1、上海外贸学院（现上海对外经贸大学）
2、广州外贸学院（现并入广东外语外贸大学）
财政部，共7所
归教育部直属2所：
1、上海财经大学（“世界一流学科建设高校”，“211工程”）
2、中央财经大学（“世界一流学科建设高校”，“211工程”）。
并入教育部直属高校2所：
1、中南财经大学（入中南财经政法大学）
2、中央财政管理干部学院（入中央财经大学）。
归省市直属3所：
1、东北财经大学
2、江西财经大学
3、山东财政学院（组建山东财经大学）
中国人民银行，共12所
归教育部直属1所：
西南财经大学（“世界一流学科建设高校”，“211工程”）。
并入教育部直属高校3所：
1、中国金融学院（入对外经贸大学）
2、湖南财经学院（入湖南大学）
3、陕西财经学院（入西安交通大学）。
归省市直属8所：
1、保定金融高等专科学校（今河北金融学院）
2、长春金融高等专科学校
3、哈尔滨金融高等专科学校（今哈尔滨金融学院）
4、上海金融高等专科学校（今上海金融学院）
5、南京金融高等专科学校（并入南京审计学院）
6、武汉金融高等专科学校（组建湖北经济学院）
7、广州金融高等专科学校（今广东金融学院）
8、哈尔滨投资高等专科学校(今中国建设银行哈尔滨培训中心)
文化部（现文旅部），共10所：
归教育部直属3所：
1、中央音乐学院（“世界一流学科建设高校”，“211工程”）
2、中央美术学院（“世界一流学科建设高校”）
3、中央戏剧学院（“世界一流学科建设高校”）
归省市直属7所：
1、中国美术学院（“世界一流学科建设高校”）
2、上海音乐学院（“世界一流学科建设高校”）
3、上海戏剧学院
4、北京电影学院
5、中国音乐学院（“世界一流学科建设高校”）
6、中国戏曲学院
7、北京舞蹈学院
商业部（1994年改组为国内贸易部，1998年改组为国内贸易局，归经贸委管理），共11所
归省市直属11所：
1、杭州商学院（浙江工商大学）
2、黑龙江商学院（哈尔滨商业大学）
3、北京商学院（合并于北京工商大学）
4、天津商学院（天津商业大学）
5、郑州粮食学院（郑州工程学院，后合并组建河南工业大学）
6、武汉食品工业学院(武汉轻工大学）
7、北京物资学院
8、南京经济学院（南京财经大学）
9、重庆商学院（合并于重庆工商大学）
10、兰州商学院
11、四川烹饪高等专科学校（组建四川旅游学院）
国家体委（现体育总局），共7所
部委直属1所：
北京体育大学（“世界一流学科建设高校”，“211工程”）
归省市直属6所：
1、上海体育学院（“世界一流学科建设高校”）
2、成都体育学院
3、武汉体育学院
4、广州体育学院
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